Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csn1s1P19228 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csn1s1P19228 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csn1s1P19228 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csn1s1P19228 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Csn1s1P19228 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csn1s1P19228 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csn1s1P19228 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csn1s1P19228 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csn1s1P19228 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csn1s1P19228 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms