Protein–RNA interactions for Protein: P15306

Thbd, Thrombomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThbdP15306 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ThbdP15306 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ThbdP15306 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ThbdP15306 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ThbdP15306 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ThbdP15306 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ThbdP15306 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ThbdP15306 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ThbdP15306 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ThbdP15306 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ThbdP15306 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ThbdP15306 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ThbdP15306 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ThbdP15306 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ThbdP15306 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ThbdP15306 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ThbdP15306 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ThbdP15306 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ThbdP15306 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ThbdP15306 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ThbdP15306 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ThbdP15306 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ThbdP15306 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ThbdP15306 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ThbdP15306 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ThbdP15306 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ThbdP15306 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ThbdP15306 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ThbdP15306 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ThbdP15306 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ThbdP15306 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ThbdP15306 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ThbdP15306 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ThbdP15306 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms