Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsbP10605 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtsbP10605 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsbP10605 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsbP10605 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtsbP10605 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsbP10605 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtsbP10605 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtsbP10605 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsbP10605 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsbP10605 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsbP10605 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms