Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Becn2P0DM65 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Becn2P0DM65 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Becn2P0DM65 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Becn2P0DM65 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Becn2P0DM65 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Becn2P0DM65 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Becn2P0DM65 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms