Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Hoxc8P09025 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Hoxc8P09025 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Hoxc8P09025 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxc8P09025 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Hoxc8P09025 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Hoxc8P09025 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Hoxc8P09025 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Hoxc8P09025 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms