Protein–RNA interactions for Protein: P08882

Gzmc, Granzyme C, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmcP08882 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GzmcP08882 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GzmcP08882 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GzmcP08882 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GzmcP08882 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GzmcP08882 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GzmcP08882 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GzmcP08882 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GzmcP08882 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GzmcP08882 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GzmcP08882 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GzmcP08882 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GzmcP08882 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GzmcP08882 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GzmcP08882 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GzmcP08882 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GzmcP08882 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GzmcP08882 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GzmcP08882 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GzmcP08882 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GzmcP08882 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GzmcP08882 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GzmcP08882 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GzmcP08882 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms