Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApoeP08226 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ApoeP08226 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApoeP08226 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ApoeP08226 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ApoeP08226 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApoeP08226 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApoeP08226 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApoeP08226 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApoeP08226 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApoeP08226 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApoeP08226 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApoeP08226 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApoeP08226 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ApoeP08226 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApoeP08226 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms