Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01853 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01853 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01853 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01853 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01853 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01853 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01853 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01853 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01853 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01853 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01853 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01853 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01853 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01853 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01853 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01853 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01853 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01853 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01853 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01853 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01853 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01853 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01853 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01853 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01853 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01853 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01853 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01853 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01853 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01853 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01853 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01853 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01853 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01853 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01853 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01853 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01853 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01853 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01853 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01853 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01853 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01853 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01853 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01853 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01853 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01853 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01853 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01853 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01853 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01853 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01853 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01853 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01853 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01853 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01853 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01853 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01853 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01853 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01853 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01853 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01853 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01853 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01853 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01853 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01853 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01853 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01853 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01853 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01853 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01853 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01853 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01853 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01853 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01853 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01853 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01853 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01853 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01853 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01853 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01853 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01853 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01853 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01853 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01853 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01853 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01853 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01853 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01853 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01853 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01853 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01853 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01853 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms