Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01789 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01789 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01789 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01789 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01789 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01789 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01789 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01789 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01789 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01789 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01789 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01789 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01789 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01789 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01789 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01789 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01789 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01789 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01789 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01789 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01789 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01789 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01789 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01789 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01789 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01789 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01789 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01789 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01789 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01789 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01789 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01789 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01789 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01789 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01789 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01789 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01789 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01789 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01789 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01789 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01789 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01789 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01789 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01789 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01789 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01789 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01789 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01789 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01789 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01789 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01789 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01789 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01789 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01789 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01789 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01789 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01789 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01789 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01789 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01789 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01789 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01789 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01789 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01789 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01789 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01789 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01789 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01789 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01789 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01789 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01789 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01789 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01789 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01789 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01789 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01789 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01789 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01789 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01789 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01789 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01789 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01789 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01789 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P01789 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01789 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01789 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01789 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01789 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01789 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01789 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01789 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01789 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms