Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl6O88848 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl6O88848 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Arl6O88848 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl6O88848 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6O88848 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6O88848 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arl6O88848 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6O88848 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6O88848 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl6O88848 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6O88848 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6O88848 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6O88848 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl6O88848 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl6O88848 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl6O88848 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6O88848 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl6O88848 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl6O88848 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arl6O88848 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6O88848 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl6O88848 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms