Protein–RNA interactions for Protein: O88559

Men1, Menin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Men1O88559 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Men1O88559 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Men1O88559 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Men1O88559 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Men1O88559 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Men1O88559 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Men1O88559 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Men1O88559 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Men1O88559 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Men1O88559 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Men1O88559 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Men1O88559 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Men1O88559 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Men1O88559 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Men1O88559 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Men1O88559 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Men1O88559 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Men1O88559 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Men1O88559 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Men1O88559 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Men1O88559 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Men1O88559 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Men1O88559 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Men1O88559 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Men1O88559 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Men1O88559 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Men1O88559 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Men1O88559 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Men1O88559 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Men1O88559 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Men1O88559 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Men1O88559 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Men1O88559 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Men1O88559 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Men1O88559 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Men1O88559 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Men1O88559 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Men1O88559 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Men1O88559 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Men1O88559 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Men1O88559 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Men1O88559 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Men1O88559 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Men1O88559 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Men1O88559 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Men1O88559 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Men1O88559 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Men1O88559 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Men1O88559 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Men1O88559 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Men1O88559 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Men1O88559 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Men1O88559 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Men1O88559 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Men1O88559 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Men1O88559 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Men1O88559 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Men1O88559 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Men1O88559 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Men1O88559 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Men1O88559 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Men1O88559 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Men1O88559 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Men1O88559 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Men1O88559 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Men1O88559 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Men1O88559 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Men1O88559 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Men1O88559 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Men1O88559 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Men1O88559 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Men1O88559 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Men1O88559 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Men1O88559 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Men1O88559 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Men1O88559 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Men1O88559 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Men1O88559 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Men1O88559 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Men1O88559 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Men1O88559 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Men1O88559 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Men1O88559 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Men1O88559 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Men1O88559 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Men1O88559 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Men1O88559 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Men1O88559 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Men1O88559 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Men1O88559 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Men1O88559 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Men1O88559 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Men1O88559 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Men1O88559 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms