Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZfrO88532 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZfrO88532 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZfrO88532 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZfrO88532 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfrO88532 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZfrO88532 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfrO88532 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfrO88532 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZfrO88532 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZfrO88532 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZfrO88532 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZfrO88532 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfrO88532 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfrO88532 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfrO88532 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZfrO88532 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfrO88532 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfrO88532 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfrO88532 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfrO88532 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms