Protein–RNA interactions for Protein: O88472

Tnfrsf17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf17O88472 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf17O88472 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf17O88472 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfrsf17O88472 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf17O88472 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf17O88472 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfrsf17O88472 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf17O88472 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfrsf17O88472 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfrsf17O88472 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms