Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox1O70477 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox1O70477 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pknox1O70477 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pknox1O70477 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox1O70477 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pknox1O70477 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pknox1O70477 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pknox1O70477 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pknox1O70477 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms