Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HcrtO55241 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HcrtO55241 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HcrtO55241 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HcrtO55241 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HcrtO55241 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HcrtO55241 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HcrtO55241 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HcrtO55241 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HcrtO55241 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HcrtO55241 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HcrtO55241 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HcrtO55241 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HcrtO55241 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HcrtO55241 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms