Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl35aO55142 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl35aO55142 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35aO55142 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl35aO55142 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms