Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngr1O55100 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syngr1O55100 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngr1O55100 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngr1O55100 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syngr1O55100 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr1O55100 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms