Protein–RNA interactions for Protein: O55040

Nmur1, Neuromedin-U receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmur1O55040 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nmur1O55040 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nmur1O55040 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nmur1O55040 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nmur1O55040 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nmur1O55040 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nmur1O55040 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms