Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkaO54804 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkaO54804 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChkaO54804 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkaO54804 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkaO54804 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkaO54804 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ChkaO54804 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ChkaO54804 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkaO54804 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkaO54804 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChkaO54804 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChkaO54804 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkaO54804 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChkaO54804 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChkaO54804 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ChkaO54804 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ChkaO54804 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChkaO54804 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChkaO54804 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChkaO54804 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChkaO54804 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChkaO54804 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChkaO54804 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms