Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NmbrO54799 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NmbrO54799 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NmbrO54799 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NmbrO54799 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NmbrO54799 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NmbrO54799 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NmbrO54799 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmbrO54799 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NmbrO54799 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbrO54799 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbrO54799 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NmbrO54799 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NmbrO54799 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NmbrO54799 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NmbrO54799 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NmbrO54799 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms