Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scamp3O35609 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scamp3O35609 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scamp3O35609 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Scamp3O35609 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scamp3O35609 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scamp3O35609 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp3O35609 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms