Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pld3O35405 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pld3O35405 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pld3O35405 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pld3O35405 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pld3O35405 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pld3O35405 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pld3O35405 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld3O35405 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pld3O35405 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pld3O35405 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pld3O35405 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pld3O35405 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld3O35405 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld3O35405 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pld3O35405 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pld3O35405 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pld3O35405 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pld3O35405 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pld3O35405 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 955.1 ms