Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf2O35218 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpsf2O35218 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpsf2O35218 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpsf2O35218 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpsf2O35218 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf2O35218 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf2O35218 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms