Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema4dO09126 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema4dO09126 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema4dO09126 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema4dO09126 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sema4dO09126 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sema4dO09126 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema4dO09126 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms