Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trove2O08848 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trove2O08848 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trove2O08848 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trove2O08848 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trove2O08848 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trove2O08848 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trove2O08848 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trove2O08848 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trove2O08848 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trove2O08848 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trove2O08848 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trove2O08848 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trove2O08848 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trove2O08848 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trove2O08848 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trove2O08848 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms