Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf6O08584 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klf6O08584 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf6O08584 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf6O08584 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klf6O08584 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klf6O08584 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klf6O08584 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf6O08584 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klf6O08584 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf6O08584 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf6O08584 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klf6O08584 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf6O08584 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms