Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top6blJ3QMY9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top6blJ3QMY9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top6blJ3QMY9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top6blJ3QMY9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top6blJ3QMY9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top6blJ3QMY9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top6blJ3QMY9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top6blJ3QMY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top6blJ3QMY9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Top6blJ3QMY9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms