Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21897J3KMP5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21897J3KMP5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21897J3KMP5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21897J3KMP5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21897J3KMP5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21897J3KMP5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms