Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdye4cI6XKQ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdye4cI6XKQ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdye4cI6XKQ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdye4cI6XKQ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdye4cI6XKQ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdye4cI6XKQ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms