Protein–RNA interactions for Protein: H3BJG9

Ly6l, Lymphocyte antigen 6L, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6lH3BJG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6lH3BJG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ly6lH3BJG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6lH3BJG9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6lH3BJG9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6lH3BJG9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ly6lH3BJG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6lH3BJG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ly6lH3BJG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6lH3BJG9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6lH3BJG9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms