Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc4lG5E8X2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc4lG5E8X2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc4lG5E8X2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc4lG5E8X2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc4lG5E8X2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc4lG5E8X2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms