Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nccrp1G3X9C2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nccrp1G3X9C2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nccrp1G3X9C2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nccrp1G3X9C2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nccrp1G3X9C2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms