Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5160F8VPN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5160F8VPN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5160F8VPN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5160F8VPN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5160F8VPN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 470.9 ms