Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M1F7CXU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-M1F7CXU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M1F7CXU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M1F7CXU4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M1F7CXU4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms