Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8005F6YKY3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8005F6YKY3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8005F6YKY3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8005F6YKY3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8005F6YKY3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8005F6YKY3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8005F6YKY3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8005F6YKY3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8005F6YKY3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms