Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8247F6VRJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8247F6VRJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8247F6VRJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8247F6VRJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8247F6VRJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8247F6VRJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8247F6VRJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8247F6VRJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8247F6VRJ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8247F6VRJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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