Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sptbn5F6UCX4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sptbn5F6UCX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sptbn5F6UCX4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sptbn5F6UCX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sptbn5F6UCX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sptbn5F6UCX4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sptbn5F6UCX4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms