Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3072F6SKY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3072F6SKY8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3072F6SKY8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms