Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm340F6RGI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm340F6RGI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm340F6RGI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm340F6RGI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm340F6RGI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm340F6RGI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms