Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnmb3E9Q7U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnmb3E9Q7U0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnmb3E9Q7U0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnmb3E9Q7U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb3E9Q7U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnmb3E9Q7U0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnmb3E9Q7U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnmb3E9Q7U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnmb3E9Q7U0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnmb3E9Q7U0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.5 ms