Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
5430401F13RikE9Q328 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
5430401F13RikE9Q328 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
5430401F13RikE9Q328 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
5430401F13RikE9Q328 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
5430401F13RikE9Q328 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
5430401F13RikE9Q328 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
5430401F13RikE9Q328 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
5430401F13RikE9Q328 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
5430401F13RikE9Q328 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
5430401F13RikE9Q328 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
5430401F13RikE9Q328 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms