Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krtap11-1E9Q2E9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krtap11-1E9Q2E9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krtap11-1E9Q2E9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms