Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Myo5cE9Q1F5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Myo5cE9Q1F5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Myo5cE9Q1F5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Myo5cE9Q1F5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Myo5cE9Q1F5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Myo5cE9Q1F5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Myo5cE9Q1F5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Myo5cE9Q1F5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Myo5cE9Q1F5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Myo5cE9Q1F5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Myo5cE9Q1F5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Myo5cE9Q1F5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Myo5cE9Q1F5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Myo5cE9Q1F5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Myo5cE9Q1F5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Myo5cE9Q1F5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Myo5cE9Q1F5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Myo5cE9Q1F5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5cE9Q1F5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms