Protein–RNA interactions for Protein: E9Q025

Vmn2r16, Vomeronasal 2, receptor 16, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r16E9Q025 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r16E9Q025 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r16E9Q025 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r16E9Q025 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r16E9Q025 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r16E9Q025 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r16E9Q025 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r16E9Q025 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r16E9Q025 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms