Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AU019823E9PUQ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AU019823E9PUQ3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AU019823E9PUQ3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
AU019823E9PUQ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AU019823E9PUQ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
AU019823E9PUQ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AU019823E9PUQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
AU019823E9PUQ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AU019823E9PUQ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU019823E9PUQ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms