Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim20D3Z7Q2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim20D3Z7Q2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim20D3Z7Q2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim20D3Z7Q2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim20D3Z7Q2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms