Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm10110D3Z5M2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm10110D3Z5M2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm10110D3Z5M2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm10110D3Z5M2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm10110D3Z5M2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm10110D3Z5M2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm10110D3Z5M2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm10110D3Z5M2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10110D3Z5M2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10110D3Z5M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10110D3Z5M2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms