Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia4B8QI36 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia4B8QI36 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia4B8QI36 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia4B8QI36 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia4B8QI36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia4B8QI36 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms