Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Uhrf1bp1B2KF50 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Uhrf1bp1B2KF50 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Uhrf1bp1B2KF50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms