Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Btbd35f28A2CFD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Btbd35f28A2CFD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Btbd35f28A2CFD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Btbd35f28A2CFD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms